Os outros dois prêmios ficaram com empresas do Sudeste. A Natura, de São Paulo, que em 2008 investiu R$ 103 milhões em pesquisa e desenvolvimento, foi a vencedora na categoria Grande Empresa. A Opto Eletrônica, de São Carlos, no interior paulista, que desenvolve equipamentos que aliam tecnologia óptica e eletrônica, foi a premiada na categoria Média Empresa. Desde a sua criação em 1985 por pesquisadores da Universidade de São Paulo, a Opto e suas afiliadas foram apoiadas com oito projetos na modalidade Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas (Pipe) da FAPESP (ver Pesquisa FAPESP no 162). Na categoria Pequena Empresa a vencedora foi a Angelus, de Londrina, no Paraná, que fabrica materiais inovadores para a odontologia, como pinos em fibras de vidro e carbono mais resistentes e flexíveis, e é parceira do Centro Multidisciplinar para o Desenvolvimento de Materiais Cerâmicos, um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão da FAPESP. A Fundação Centros de Referência em Tecnologias Inovadoras (Certi), sediada no campus da Universidade Federal de Santa Catarina, um instituto de tecnologia privado sem fins lucrativos, foi premiada como Instituição de Ciência e Tecnologia. A Embrapa Clima Temperado, do Rio Grande do Sul, foi a vencedora na categoria Tecnologia Social com o projeto Quintais Orgânicos de Frutas, que já implantou mais de 910 pomares na Região Sul, com cerca de 63 mil árvores. O catarinense Roberto Zagonel foi o vencedor na categoria Inventor Inovador, por um chuveiro elétrico com cinco opções de temperatura, a Master Ducha Zagonel, há 14 anos no mercado e líder de vendas na Região Sul.
